Jmol nápověda

Standardní barvy prvků v programu Jmol

Umístěte myš na prvek pro zobrazení dalších informací (protonové číslo, symbol, český a anglický název prvku)

H   He
Li Be   B C N O F Ne
Na Mg   Al Si P S Cl Ar
K Ca Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu Zn Ga Ge As Se Br Kr
Rb Sr Y Zr Nb Mo Tc Ru Rh Pd Ag Cd In Sn Sb Te I Xe
Cs Ba * Hf Ta W Re Os Ir Pt Au Hg Tl Pb Bi Po At Rn
Fr Ra ** Rf Db Sg Bh Hs Mt                  
 
  * La Ce Pr Nd Pm Sm Eu Gd Tb Dy Ho Er Tm Yb Lu  
  ** Ac Th Pa U Np Pu Am Cm Bk Cf Es Fm Md No Lr  
 

 

Jmol: ovládání myší

 

Jmol lze ovládat 1-tlačítkovou (např. Macintosh), 2-tlačítkovou (např. Windows), 3-tlačítkovou (např. Linux) myší nebo myší s kolečkem -_o.

Akce Hlavní (levé) tlačítko Střední tlačítko Pomocné (pravé) tlačítko
Jmol: nabídka Klepněte na logo Jmol
nebo Ctrl + klepnout
  klepnout
Rotace X,Y klepnout & táhnout    
Translace (posun) X,Y Shift + poklepat & táhnout poklepat & táhnout Ctrl + klepnout & táhnout
Rotace Z Shift + klepnout & táhnout vodorovně klepnout & táhnout vodorovně Shift + klepnout & táhnout vodorovně
Zoom Shift + klepnout & táhnout svisle klepnout & táhnout svisle
nebo kolečko myši
 
Znovu nastavit & střed Shift + poklepat (mimo molekulu) poklepat (mimo molekulu)  
 

 

Jmol: měření

Vzdálenost (2 atomy):

  1. poklepat na první atom
  2. poklepat na druhý atom (pak se zobrazí se vzdálenost mezi atomy)

Úhel (3 atomy):

  1. poklepat na první atom
  2. klepnout na druhý atom (ve vrcholu úhlu)
  3. poklepat na třetí atom (pak se zobrazí se velikost úhlu)

Torzní nebo dihedrální úhel (4 atomy)

  1. poklepat na první atom
  2. klepnout na druhý atom
  3. klepnout na třetí atom
  4. poklepat na čtvrtý atom (pak se zobrazí se velikost úhlu)

Vždy:

  1. přesuňte ukazatel myši přes cílový atom, abyste viděli výsledky měření bez ovlivnění již zobrazených měření
  2. přesuňte ukazatel myši mimo okno pro zrušení měření
  3. pro vymazání hodnot měření proveďte stejné měření ještě jednou

Další informace o Jmolu: https://jmol.sourceforge.net/.

Zpět na vizualizaci nanostruktur.