Obrazová analýza mikrobiálních buněk a biofilmů

Cílem práce je využití moderního přístupu analýzy obrazu k hodnocení bakteriálního biofilmu na nosičích biomasy. Využití analýzy obrazu v biologických oborech (především mikrobiologie) stále není dostatečně rozšířené, proto je velice příhodné tento zájem rozšiřovat. Cílem práce je vyvinout programový kód (metodiku hodnocení), který bude charakterizovat bakteriální biofilm (na podkladových materiálech, nosičích). Charakterizace obnáší hodnocení 2D struktur biofilmu (jako například fraktální dimenze, entropie, difuzní vzdálenost a další). Cílem práce je vytvoření aplikace, která bude schopna automatické analýzy obrazu biofilmových struktur. Cílem je odhalit, jakým způsobem se formuje bakteriální biofilm v závislosti na vnějších podmínkách, což jinak než mikroskopickým pozorováním a následnou analýzou obrazu, odhalit nelze.